A Escola e Ambulatório Pe. João Maria foi fundada em 15 de julho de 1946 pelo então Pe. Eugênio Sales, mais tarde, Cardeal Arcebispo do Rio de janeiro. Na época, o referido prelado era Assistente Eclesiástico da Juventude Masculina Católica que, no seu agir, concretizou a implantação de várias Obras Sociais em bairros periféricos de Natal.
Um objetivo geral presidiu a realização de tais implantações: cada obra social serviria de apoio ao trabalho pastoral da Igreja de Natal. Os objetivos específicos seriam determinados de acordo com a especificidade da resposta dada pela obra e determinados problemas sociais. Nesse contexto surgiu a Escola e Ambulatório Pe. João Maria, situada no Morro Branco, bairro considerado até a década de 1960 como periferia da cidade.
Atendia os mais pobres através da escolarização, recreação, Assistência Alimentar e Sanitária. Desde os seus primórdios, conferiu prioridade à catequese de crianças e formação da juventude, através de Grupos de Jovens. Aos domingos, a Celebração Eucarística congregava a comunidade em um dos salões da Escola que funcionava como Capela. Esta, até 1963, realizava atividades pastorais como um anexo da Paróquia de São Pedro. Em 1963 foi criada a Paróquia do Sagrado Coração de Jesus do Morro Branco, confiada aos Padres Redentoristas.
Desde a fundação da Escola, a Igreja de Natal solicitou à Companhia das Filhas da Caridade a liberação de uma Irmã para assumir a supervisão dos trabalhos. Além da Escola com os serviços já citados, a população do bairro era ainda beneficiada com o Clube de Mães e o Centro Social de Comunidade que ainda sobrevivem. A Irmã designada pertenceu, inicialmente, à Comunidade do Patronato da Medalha Milagrosa e, posteriormente, à Comunidade do Instituto Juvino Barreto.
De 1946 a 1949, a Irmã Vicência Araújo esteve à frente dos trabalhos da Escola e Ambulatório Pe. João Maria. Funcionava, na época, com os seguintes serviços: Setor Religioso – Catequese, Batismo de crianças, Casamentos, Celebrações Eucarísticas. Setor Social – Escola Primária, Clube de Jovens, Sopa-almoço para crianças.
A Segunda Diretora, Irmã Helena Pereira, esteve presente de 1949 a 1961. Deu continuidade ao trabalho da instituição e, no seu mandato, foi inaugurada a Casa da Criança a 11 de outubro de 1951. Desde então, as duas organizações – Escola Pe. João Maria e Casa da Criança – funcionam no mesmo prédio, hoje bastante ampliado, com objetivos e normas institucionalizados num mesmo Estatuto. A Casa da Criança passou a receber menores de 01 a 10 anos em regime de internato (casos extremos de abandono, orfandade e impedimentos graves por parte dos pais), semi-internato (durante o período de trabalho das mães fora do lar) e externato para o Ensino Fundamental.
Em 1961, a então provincial – Irmã Helena Marcillac – liberou a Irmã Lúcia Montenegro para o trabalho Sócio Pastoral da Arquidiocese, especialmente para as atividades da obra citada. O trabalho da Igreja no setor sócio pastoral é realizado com apoio em 24 Obras Sociais que integram o Serviço de Ação Urbana, fundado em 1965 pelo Arcebispo D. Nivaldo Monte.
Com as bênçãos de Deus, os serviços realizados pelas duas organizações anexas continuam em nível crescente, sendo uma de suas características a absorção do trabalho de leigos sob coordenação das Irmãs.
Em 1981, com licença da respeitável Provincial Irmã Maia, a obra desdobra-se em nova implantação: constrói a Capela-Escola São Vicente de Paulo, junto aos mais pobres do bairro Dix-Sept-Rosado. Evangelização, Catequese, Celebrações Litúrgicas são assim prioridades do novo empreendimento. A Casa da Criança é referência no estado de Natal em atendimento e cuidado às crianças favorecendo educação de qualidade e de evangelização. As Irmãs com audácia e disponibilidade vivem o amor afetivo e efetivo.